Formation ImageJ et analyse d’images
PROGRAMME :
Matin (Cours théorique) - 09h00 - 12h30
L’image
• Pixel
• Niveaux de gris/couleurs (RGB)
• Résolution Vs. Qualité
• Formats d’image les plus utilisés
Traitement d’image
• Histogramme
• Filtres d’optimisation et correction
Analyse d’image
• Seuillage et segmentation
ImageJ
• Introduction
• Installation et fonctionnement
• Plugins
• Quantification
• Macro
• "Troubleshooting"
Après-midi (Cours pratique) - 13h30 - 17h00
ImageJ
• Installation et mise en route (si besoin)
• Echelle (post-acquisition)
Couleurs
• Split/merge
• Code couleurs
3D
• Projection, vue orthogonale
• 3D viewer
Quantification
• Morphologique
• "Cell counter"
• "Particle analyser"
Autres applications
• Modèles d'angiogenèse
Macro recorder